ЯМР-метаболомика: практический курс

Курс состоит из 6 следующих модулей:

1. Введение в метаболомный анализ.
2. Методы профилирования в метаболомике. Основы спектроскопии ЯМР.
3. Основы пробоподготовки и регистрации спектров ЯМР.
4. Программное обеспечение для обработки спектров ЯМР.
5. Базы данных метаболитов и статистические методы обработки полученных данных.
6. Примеры использования метода спектроскопии ЯМР в метаболомном анализе.

Содержание и описание курса:

1. Введение в метаболомный анализ. В данном модуле обучающимися будут изучены основные термины и понятия метаболомного анализа. Будут рассмотрены основные этапы проведения метаболомных исследований. Изучены области применения метаболомного анализа, а также объекты, которые возможно профилировать с помощью инструментальных методов анализа.

2. Методы профилирования в метаболомике. Основы спектроскопии ЯМР. В этом модуле курса будут рассмотрены основные инструментальные методы анализа в метаболомных исследованиях (масс-спектрометрия и спектроскопия ЯМР). Будут рассмотрены основы спектроскопии ЯМР.

3. Основы пробоподготовки и регистрации спектров ЯМР. В этом модуле будут рассмотрены основные моменты и этапы пробоподготовки, особенности пробоподготовки объектов различного происхождения (плазма и сыворотка крови, моча, кал и другие биофлюиды человека, растительные объекты). Также будут рассмотрены используемые в метаболомном анализе методом спектроскопии ЯМР импульсные последовательности (CPMG, 1D NOSY и т.д.) и особенности настройки этих экспериментов.  

4. Программное обеспечение для обработки спектров ЯМР. В этом модуле будут рассмотрены основное программное обеспечение, используемое для обработки спектров ЯМР (фазирование, настройка базовой линии и т.д.), а также программное обеспечение, используемое для метаболомного профилирования биологических жидкостей. Будут рассмотрены следующее программное обеспечение: MestRe Nova, Chenomx NMR Siute.

5. Базы данных метаболитов и статистические методы обработки полученных данных. В этом модуле будут рассмотрены основные базы данных метаболитов человека, продуктов питания и т.д. и возможность их использования в реальных исследованиях. Будут рассмотрены основные статистические походы к анализу массивов данных, получаемых при метаболомном профилировании образцов.

6. Примеры использования метода спектроскопии ЯМР в метаболомном анализе. В этом модуле будут рассмотрены примеры метаболомного анализа объектов различных биологических образцов.

После завершения данного курса слушатели будут иметь представление об основах метаболомного анализа, узнают основы метода спектроскопии ЯМР в приложении к задачам метаболомики, получат знания об особенностях проведения экспериментов по ЯМР-метаболомике, приобретут базовые навыки анализа данных по ЯМР-метаболомике с использованием различного программного обеспечения, освоят основы статистических подходов, применяемых при обработке результатов метаболомного анализа. Также слушатели будут иметь представление о приложениях ЯМР-метаболомики к решению биологических задач.