Введение в биоинформатику

Курс нацелен на изучение методов подготовки метагеномных проб и особенностей
их анализа; математических подходов, лежащих в основе созданных специально для этого
типа данных программных продуктов; вопросы секвенирования и сборки метагеномов‚ их
аннотации и применения.

Форма обучения заочная (дистанционная). Еженедельные занятия будут включать просмотр тематических видеолекций, изучение дополнительных материалов и выполнение тестовых заданий с автоматизированной проверкой результатов, тестирование по пройденному материалу. Для получения сертификата необходимо выполнить все задания, тесты и написать финальный экзамен.

Курс предназначен для тех, кто готов учиться, готов осваивать новые, передовые знания, необходимые уже сегодня всем биологам, медикам, экологам и многим другим. Навыки программирования не обязательны, но очень приветствуются. 

Модуль 1. Введение

Модуль 2. Технологии секвенирования

Модуль 3. Контроль качества

Модуль 4, Сборка ДНК de novo

Модуль 5. Выравнивание коротких фрагментов

Модуль 6. Поиск и аннотация генов 

Итоговый проект: Геномный проект

• задачи, которые ставят необходимость исследования сложных микробных сообществ перед медиками, биологами, программистами и математиками;
• методы и подходы их решения;
• программные продукты и аналитические платформы, созданные для работы с метагеномными данными;
• математические алгоритмы, лежащие в основе таких программ.

• правильно планировать эксперимент;
• оценивать сложность задач и требуемых для их решения ресурсов (лабораторных и компьютерных);

• оценивать качество произведенных данных с точки зрения поставленной задачи;
• правильно выбирать и создавать программные продукты для решения поставленной задачи.

ОПК-1. Способность решать стандартные задачи профессиональной деятельности на основе информационной и библиографической культуры с применением информационно-коммуникационных технологий и с учетом основных требований информационной безопасности.
ПК-8. Способность использовать основные технические средства поиска научно-биологической информации, универсальные пакеты прикладных компьютерных программ, создавать базы экспериментальных биологических данных, работать с биологической информацией в глобальных компьютерных сетях.