Введение в биоинформатику

Курс нацелен на изучение методов подготовки метагеномных проб и особенностей
их анализа; математических подходов, лежащих в основе созданных специально для этого
типа данных программных продуктов; вопросы секвенирования и сборки метагеномов‚ их
аннотации и применения.

Форма обучения заочная (дистанционная). Еженедельные занятия будут включать просмотр тематических видеолекций, изучение дополнительных материалов и выполнение тестовых заданий с автоматизированной проверкой результатов, тестирование по пройденному материалу. Для получения сертификата необходимо выполнить все задания, тесты и написать финальный экзамен.

Этот курс может быть интересен бакалаврам, магистрантам и аспирантам высших учебных заведений, а также всем тем, кому интересна обозначенная тема. Потенциальным работникам курс позволит получить научно-обоснованную информацию, дающую конкурентное преимущество при собственном трудоустройстве.

Модуль 1. Введение

Модуль 2. Технологии секвенирования

Модуль 3. Контроль качества

Модуль 4, Сборка ДНК de novo

Модуль 5. Выравнивание коротких фрагментов

Модуль 6. Поиск и аннотация генов 

Итоговый проект: Геномный проект

Дисциплина направлена на формирование универсальных компетенций обучающихся по образовательным программам бакалавриата/специалитета, а также иных компетенций, предусмотренных образовательной программой.

1. Знать и понимать:

• задачи, которые ставят необходимость исследования сложных микробных сообществ перед медиками, биологами, программистами и математиками;
• методы и подходы их решения;
• программные продукты и аналитические платформы, созданные для работы с метагеномными данными;
• математические алгоритмы, лежащие в основе таких программ.

2. Уметь:

• правильно планировать эксперимент;
• оценивать сложность задач и требуемых для их решения ресурсов (лабораторных и компьютерных);
• оценивать качество произведенных данных с точки зрения поставленной задачи;
• правильно выбирать и создавать программные продукты для решения поставленной задачи.