up

Введение в биоинформатику

18 January - 31 December 2023 г.
The course has already started
328 days
Before the end of the enrollment
  • Russian

    course language

  • 7 weeks

    course duration

  • about 8 hours per week

    needed to educate

  • 2 credit points

    for credit at your university

Курс «Введение в биоинформатику» адресован тем, кто хочет получить расширенное представление о том, что такое биоинформатика и как она помогает биологам и медикам в их работе.

About

Курс нацелен на изучение методов подготовки метагеномных проб и особенностей
их анализа; математических подходов, лежащих в основе созданных специально для этого
типа данных программных продуктов; вопросы секвенирования и сборки метагеномов‚ их
аннотации и применения.

Format

Форма обучения заочная (дистанционная). Еженедельные занятия будут включать просмотр тематических видеолекций, изучение дополнительных материалов и выполнение тестовых заданий с автоматизированной проверкой результатов, тестирование по пройденному материалу. Для получения сертификата необходимо выполнить все задания, тесты и написать финальный экзамен.

Requirements

Этот курс может быть интересен бакалаврам, магистрантам и аспирантам высших учебных заведений, а также всем тем, кому интересна обозначенная тема. Потенциальным работникам курс позволит получить научно-обоснованную информацию, дающую конкурентное преимущество при собственном трудоустройстве.

Course program

Модуль 1. Введение

Модуль 2. Технологии секвенирования

Модуль 3. Контроль качества

Модуль 4, Сборка ДНК de novo

Модуль 5. Выравнивание коротких фрагментов

Модуль 6. Поиск и аннотация генов 

Итоговый проект: Геномный проект

Formed competencies

Дисциплина направлена на формирование универсальных компетенций обучающихся по образовательным программам бакалавриата/специалитета, а также иных компетенций, предусмотренных образовательной программой.

Education directions

Knowledge

1. Знать и понимать:

  • задачи, которые ставят необходимость исследования сложных микробных сообществ перед медиками, биологами, программистами и математиками;
  • методы и подходы их решения;
  • программные продукты и аналитические платформы, созданные для работы с метагеномными данными;
  • математические алгоритмы, лежащие в основе таких программ.

Abilities

2. Уметь:

  • правильно планировать эксперимент;
  • оценивать сложность задач и требуемых для их решения ресурсов (лабораторных и компьютерных);
  • оценивать качество произведенных данных с точки зрения поставленной задачи;
  • правильно выбирать и создавать программные продукты для решения поставленной задачи.

Лапидус Алла Львовна

Кандидат биологических наук
Position: Профессор кафедры цитологии и гистологии; руководитель лаборатории "Центр алгоритмической биотехнологии"

Вяххи Николай Иванович


Position: директор Института биоинформатики, Санкт-Петербург

Добрынин Павел Владимирович


Position: младший научный сотрудник центра геномной биоинформатики им. Ф. Г. Добржанского

Райко Михаил Петрович

Кандидат биологических наук
Position: постдок, Калифорнийский университет в Сан-Диего

Черняева Екатерина Николаевна

Кандидат биологических наук
Position: старший научный сотрудник, Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г. Добржанского

Certificate

Сертификат выдается при условии успешного выполнения контрольных заданий по материалам каждого модуля и выполнения итоговой аттестации с прокторингом.

Similar courses